本次南海水下考古队由来自北京、海南、福建、上海等地的２０余名专业水下考古队员组成，主要围绕永乐群岛的华光礁、北礁、盘石屿、永乐环礁进行，还补充调查了宣德群岛的七连屿和浪花礁。经过３５天的海上艰苦作业，行程６００多海里，考古队共调查登陆水下文化遗存４２处，其中复查１０处，新发现３２处。在这４２处水下文化遗存中，沉船遗址１４处，遗物点２７处，线索地点１处。
本次水下考古队在西沙群岛海域多个地点发现了元代青花瓷器船货。主要发现的器型有碗、杯、瓶、罐等，青花纹样丰富，有鸳鸯莲池纹、缠枝菊纹、莲瓣纹等，线条简约流畅，为典型的元青花风格，这是我国水下考古工作者在南海海域首次确认了元代青花瓷器的发现，丰富了对北宋以来各时期海外贸易情况的认识，弥补了元代货船在南海实物史料的不足。
据考古队此次调查发现，古代航海遗存年代跨度较大，北宋晚期至清代晚期均有发现，以北宋晚期至南宋早期、元代、明代中期、明代晚期、清代中晚期几个阶段的遗存尤为集中。
本次水下考古还采集了更加丰富的文物标本，主要有瓷器、碇石、建筑构件、铜钱等各类遗物。
２０１０西沙水下考古队副队长黎吉龙表示，本次调查工作发现西沙海域水下文化遗存的盗掘情况依然严重，一些岛礁盗坑密布，水下文化遗产保护依然面临盗掘者的严酷威胁。因此呼吁加强各沿海口岸的监管和审查制度建立，加强规范海上作业者的行为准则，建立相关机构联动机制和法规建设，运用科技手段实现海上大遗址的远程监测。
